Nuo 2010 metų sausio 1 dienos pradėjo dirbti nauja Dzūkijos nacionalinio parko ir Čepkelių valstybinio gamtinio rezervato direkcija. Dvi buvę direkcijos apjungtos remiantis Valstybinės saugomų teritorijų tarnybos prie Aplinkos ministerijos 2009 m. rugpjūčio 25 d. direktoriaus įsakymu Nr. V – 137 „Dėl Čepkelių valstybinio gamtinio rezervato direkcijos reorganizavimo prijungimo būdu prie Dzūkijos nacionalinio parko direkcijos“.